首先我认为公司的“跨部门沟通”是有两个含义的：
第一种含义：字面上的意思，就是两个不同部门人与人之间说话的那种沟通，就是交流。
第二种含义：更深一点的意思，两个不同部门之间文件、流程、环节、协作配合的沟通。
第一个沟通含义，人与人之间
这是属于人与人方面的感情交流，只要公司领导者注意同事之间的相处，及时调节矛盾，并且时不时组织团建活动，大家感情上去了，沟通起来也就方便多了。所以我说这种沟通效率是好提高的，因为都是来上班挣钱的，没有什么深仇大恨。
第二个沟通含义，部门与部门之间
这种是属于不同部门之间协作办公，互相支持帮助，遵循企业流程的“沟通”层面。
这种沟通效率提升必须要找到正确的方法或者手段，才能有效提升沟通效率。这种两个部门之间的沟通效率高低很大程度的影响了企业的办公效率，所以也变相的成为了寻求提升企业办公效率的方法。
如果是从部门协作配合、流程环节方面入手提升效率的话，可以考虑引入一款OA办公协同系统。
现在基本上所有企业都会考虑通过引入OA系统来提升企业的办公效率，因为OA协同系统就是为了加强各个不同部门之间的协作办公与交流所开发的。
我可以给你看一下我们公司目前在用的一款叫OA易企管的OA办公协同系统：
这是流程申请审批模块，当不同部门出现项目或者流程交集时，你就可以看该流程的状态（通过、申请中、未通过等等），然后可以发现没有通过是因为那个部门或者环节没有到位，然后去具体分析解决。
这是首页，能够在通知公告看到今天最新的企业公告，比如某部门要在14:00借用会议室开会，这样别的部门要用会议室就会换个时间，也是提升了效率。
企业的信息档案管理，像这个功能包括其他功能模块都是可以进行权限管理的，设定成某个部门只能查看自己部门的档案业务、信息、流程审批情况等等。
最后
在购买了这个OA系统之后，工作效率也确实有了相应的提升，工作思路（知道什么环节出现什么问题，该找谁解决）也清晰了不少。所以还是比较有帮助的，你要是感兴趣可以去他们官网看看或者试用一下。相对来讲价格也还是比较优惠（我是说同类型产品，因为之前对比过）的，对于初创公司来说是比较友好的。
这是个好问题！我是创业者，我有些经验和大家分享。
初创公司的特点会影响部门间的沟通与协作，表现在：
1、公司制度、流程、规范处于建设中，各部门职责区分不是很清楚，会发生类似“有的事一窝蜂，有的事没人管”的现象，因此经常需要沟通和协调；
2、创业初期，除老板外，员工入职的时间和职级比较平均，管理者的权威不足，大量事情会习惯性汇聚到老板，老板花很多时间做协调，作决策，影响沟通效率；
3、初创期，老板及管理者忙于市场，在公司的时间不多，大量的管理工作在非公司现场完成，客观上影响沟通效率；
4、初创公司，内部的沟通平台尚不完善，沟通的工具比较初级，也会影响沟通的效率。
结合现实，我公司在提高跨部门沟通效率，做法如下：
1、利用QQ群、微信群和一些会议软件，低成本建设沟通平台，日常事情在平台上充分沟通，老板适时监控和指导；
2、建立了一套名为“加水”的绩效评估补充方法，对无法区分的职责、无法量化的业绩，采用员工“加水”（互评）的方式，月终，“水”（票数）可以兑换相应的礼品，年终评选“水王”，公司重奖。
3、公司推行“内勤服务外勤、外勤服务客户”的大服务理念，每个部门把自身打造成“服务中心”，以经营“小型服务公司”的意识来开展工作；
4、在沟通方式上，倡导“能见面尽量不打电话，能电话尽量不发短信，能发短信尽量不发邮件”的沟通习惯，用最直接、最高效的沟通方式解决问题；
5、老板充分授权，给部门负责人权力，企业内推行“双向负责”的理念，倡导员工敢于要权，通于担责的氛围。
总之，初创期企业，建立共识比区分职责更重要，管理层级要扁平，内部沟通要简单、直接、高效。这样，沟通效率就会高很多。
谢邀.
其实无论是初创企业，还是百年老字号企业，跨部门跨组织的沟通带来的效率内耗都会存在问题，甚至是阻碍企业发展生存的第一大瓶颈，作为企业负责人或管理层都是老生常谈的头痛问题.
题主问到是初创公司，更多是因为基本的流程规范，执行标准和落地跟进的问题.这里简单从这个角度切入展开讲一下，给出个口诀就是:一事一议，有议必有决，有决必有行，有行必有果.
不要小看这个口诀，谁都能想到，但真正能做到的初创企业真心不多，当你觉得企业中跨组织/部门的事项日常受阻，包括不限于比如沟通，执行，流程流转，事项推动跟进，组合磨合，资源及安排等出现各类问题或冲突，就想想在这方面是否出了问题.
在我看来如能切实的把口诀落地执行，行之有效，则大面积有代表性的跨部门跨组织问题则引刃而解.
下面我们展开来说说:
1.一事一议
每日重大事情繁多，如何能作到一事一议?
重大事情提前规划，相关部门提前知晓，相关人员提前准备.只有做到以上，我们每一件事就能好好的讨论，并得到有效的结果.
反例:XX重大会议明天要召开.XX重大流程明天就讨论定案.试问，当大家都忙得里外不顾的时候，突然接到通知，所有资源计划及安排都要因为这个突然插进来的事项重新梳理，还有时间去提前思考顾及重大会议内容的解决方案吗?
2.有议必有决
有决议，说明会议通过了有效充分的讨论并有了结果.这里重点是两个.
a.有效充分
最起码相关部门有决策权的人员参与了讨论有时候决议会牵扯更多的东西，比如讨论到用户奖励，影响到数据如何收集，结算如何进行，KPI是否要调整，哪些人来执行配合及监管等等诸如此类，要给他们时间去解决或统筹考虑进来b.有决议
任何会议内容形成会议纪录，重点是:明确后续跟进事项，执行人，执行时间，完成标准;如果是流程需要流程文案，明确各环节责任.各项内容要符合SMART原则.流程决议如果是跨部门跨组织的，更应该邮件所有相关人，并且明确流程的监督者企业如果规模在100人以上，建议要成立专门的SOP岗，或者PMO(项目管理办公室)组织来监督流程的执行.反例:XX重大流程口头约定;或XX重大流程直接颁布，具体执行部门前面并不知情.
3.有决必有行
大家达成一致有决议了，接下来就是执行
这在很多企业里面也会有问题，大会小会下来都没问题，就是不执行或者变相执行标准.这就要看管理层的意志是否坚决了.
补充一点，决议内容里最好要明确奖罚机制，越是重大不容易推动的事情越需要这样的机制来保障.并且奖要有感觉，罚要能痛心.降级降薪开除，杀一敬百都是这种关键环节可以参考的手段之一.
反例:企业月会上REVIEW进展，XX事项进展不到位，老板说XX同志要抓紧啊然后就没下文了;奖罚一定明确，执行不到位坚决进行处罚，才能让机制长久良好执行.
4.有行必有果
事情已开展了就有结果，无论好坏无论是否按时或符合质量要求，有了前面的标准都能在任何时候有个准确的状态给予.
许多企业往往是前几项做得不够，却过多过严的审视最后的结果，自然是千奇百怪的问题，且追溯不到问题的根本.前面进行得好，自然会有预期中的结果，
无论结果如何，奖罚跟上，机制沉淀，形成标准，全员推广，这后续的良好循环则得以持续.
反例:XX事项做完了吗?回答:做完了.然后没下文了.要切实检查执行效果，要切实落地对应的政策或承诺，要切实形成后续影响和推动.
以上四点就是口诀:一事一议，有议必有决，有决必有行，有行必有果的展开解读了，以我为多家公司从事管理或咨询的经历来看，万事组织开展有效的基础即基于此，做好不容易，事关企业政治，领导人/管理层管理风格，立规则及监管的资源以及各相关主要人的配合.希望能帮到大家.
做为初创公司，或者说大多数公司来说，跨部门沟通的难点主要在于：
一、部门之间有合作需求，但也有竞争关系。
二、部门之间没有权利制约，可以听也可以不听。
三、沟通手段有限，一般来讲主要以建议和通知及咨询为主。
在改善上可能很多人都会提到，改善沟通的心态、习惯、方式等等各种方法，但是这仅仅是从自身出发的方式和方法。我主要给一点公司管理方面的建议.
第一、提升内部服务意识。由领导者通过会议和公司文化建设，倡议提出公司需要各部门协作，才能共同发展的观点。领导一定要够分量，这样能起到一定的威慑作用，解决明面上的一部分部门配合的问题。
第二、树立共同的目标，找到共同利益点。在现代企业管理中，我们很容了解到一个概念叫横向管理体系，即，各部门职能链接存在互相服务，互相制约的关系，他们的运作过程组成一个网络互相影响。那么部门交集的地方即是我们共同的目标和利益点。
第三、梳理模糊地带完善职能职责。也就是说我们必须划分清楚这部分工作到底是是不是该部门的职责范围，此部门到底是否需要为结果负责。
第四、完善跨部门流程，搭建跨部门沟通的桥梁。我们其实也发现在跨部门沟通的过程中有些公司，只是负责人派个员工就到另外一个部门说我们老大说需要什么什么。这既然不对，那我们就要完善当A部门需要B部门协助的时候的必要流程。到底是先发公函呢？还是先走审批流程。完善之后自然能提高相应效率。
第五、开好跨部门高效会议。管理者利用自身职务权责，召集协调各部门之间的沟通协作的问题。
以上是我个人的一些建议，其实不管是初创公司也好，还是存在这种问题的公司也好。我们只要明白无规矩不成方圆，建立好体系，管理者居中协调，自然能够极大的改善相关状况。
欢迎关注点赞，留言交流，互相学习，我是一位职场创作者。