非常荣幸看到你的提问，但我在化学方面是个小白，无法帮助到你，因为专业的事我也不能乱说一通。
很高兴回答你的问题。
由于我用的ios系统，所以不确定安卓和windows是否有哈
1.AtomicOrbitalz一款原子轨道3D软件，直观展示原子轨道形状。非常有利于初学者快速入门。但是只有spdf轨道，而且收费6元。可以直接看中国大学慕课有机化学分子建模课程的演示。
2.Webmo一款可以绘制化合物3D模型和做一些简单的计算的软件。有免费版和付费版。3.Reactionflash一款有机人名反应软件。
谢谢邀请1烧杯
烧杯是一款非常有创意且有趣的学习类APP，150多种药剂、300多种神奇的化学反应任你尝试。它能把你的iPhone、iPad或安卓手机瞬间变成一个“烧杯”，不！甚至可以说是一个化学实验室！
你可以像游戏一样，随时随地随意模拟做出各种化学实验，不仅可以直接观察各种化学反应，而且你完全无需准备试剂/材料，还能远离危险更加安全。2鸿鹄3D化学
鸿鹄3D化学是专门为理科生准备的化学学习软件，能快速展示常见物质微观的3D空间结构（分子、晶体），且能在数秒钟内创作出精美绝伦的3D分子结构，包括球棍模型、比例模型、甚至显示分子电子云！支持30种化学语言格式文件，是不可多得的化学多媒体辅助教学工具。3仿真化学实验室
仿真化学实验室是专门针对初中化学课程而提供的实验室，仿真化学实验室利用仿真技术提供了一个虚拟的化学实验室。
在这里拥有试管、烧杯、酒精灯、铁架台、烧瓶、锥形瓶、集气瓶、漏斗、导管等这些真实实验室中的器具，通过仿真化学实验室软件可以学习到更多化学知识，提高学生的动手能力。
很高兴看到你提出的问题，首先对您说声不好意思，我不擅长这方面的专业，帮不到您，谢谢！
hello大家好，我是让学习变得容易的“易学school”杰哥老师，做为化学老师杰哥在这方面还是很有发言全的，为了避免出现推广嫌疑，杰哥今天只推荐三款初中化学方面最好的软件
化学是一门基础的自然科学，中学化学是化学教育的启蒙和基础阶段，它不仅能为学生升入高一级学校有关专业奠定基础，也能为毕业生参加工作解决处理一些实际问题打下基础。
1、NB化学实验室
专为初中生和高中生打造的化学物真实验软件，可以方便将初中化学的各种实验以3D的效果来展现出来，是您教学或者学习化学的得力助手。NB化学虚拟实验室还拥有3D分子模型的功能，可以让学习者充分了解化学的各个结构
2、化学方程式计算助手
化学方程式计算助手是一款非常实用的软件，它可以帮助学生练习各种化学公式，如模拟方程式的配平、溶液混合的运算、式量的计算等，对学生练习化学方程式非常有帮助。
3、101教育PPT
101教育PPT是一款备授课神器，帮助老师轻松备课高效授课。软件内含化学课程课件及268个精品化学实验视频资源，覆盖人教版九年级和高中全学段。选择好教材章节后，会自动匹配出相应的化学实验视频，一键即可查看、调用、下载。
“易学school”杰哥老师的总结：
软件只是让我们化学老师上课更方便，课程更精彩，让学生学习更感兴趣，更好的接受知识和内容，还有两点更为重要的地方
1、老师：责任心以及丰富的教学经验积累；
2、学生：上进行以及勇往直前的学习态度。